今作っているWebアプリケーションでサーバのログファイルをダウンロードしたいという要件があり、そこでganymedを使ってみることにしました。アプリケーションをデプロイしているサーバとは別に複数存在するサーバ上にあるログファイルを画面から選択してクリックでダウンロードという流れです。
　なお、サーバとログファイルが格納されているディレクトリ情報は別途ＤＢ等から取る形にして、下記はSFTPでファイルを取得する箇所の抜粋です。

POM.xml ganymed指定

    <dependency>
	  <groupId>ch.ethz.ganymed</groupId>
	  <artifactId>ganymed-ssh2</artifactId>
	  <version>262</version>
     </dependency>

画面に表示するログファイル情報

public class LogFile {
	
	/** ファイル名 */
	private String fileName;
	
	/** 更新日時 */
	private String upDateTime;
	
	/** ディレクトリ */
	private String directory;
	
	/** サイズ */
	private long fileSize;
	
	/** ホスト名 */
	private String hostName;

以下、ゲッタとセッタは割愛

SFTP処理
※サーバは一般的なID・パスワード認証です。

import ch.ethz.ssh2.Connection;
import ch.ethz.ssh2.SFTPv3Client;
import ch.ethz.ssh2.SFTPv3DirectoryEntry;
import ch.ethz.ssh2.SFTPv3FileHandle;

/**
 * SFTPファイルアクセスクラス by Ganymed SSH-2
 * */
@Stateless
public class SFTPFileAccess {
	private final int PORT = 22;
	private SFTPv3Client sftp = null;
	private Connection conn = null;
	
	/**
	 * リモートホストへログインします
	 * @param HostName リモートホスト名
	 * @param User ログインユーザー名
	 * @param Password ログインパスワード
	 * @throws IOException 
	 * 
	 * */
	public boolean loginHost(String HostName, String User, String Password) throws IOException{
		conn = new Connection(HostName, PORT);

		conn.connect();
        if (!conn.authenticateWithPassword(User, Password)) {
        	//エラー
        	return false;
        }
        return true;
	}
	
	/**
	 * リモートホスト接続をクローズします
	 * @throws IOException 
	 * 
	 * */
	public void logOutHost() throws IOException{
		if(conn != null){
			conn.close();
		}
        return;
	}

	/**
	 * リモートホスト上の指定ディレクトリのファイル一覧を取得する
	 * @param String RemoteDir ディレクトリ名
	 * @param List<LogFile> セットするファイル一覧
	 * @throws IOException
	 * */
	public void getSFTPList(String RemoteDir, List<LogFile> FileList) throws IOException {
		if(conn == null){
			return;
		}
        sftp = new SFTPv3Client(conn);
        
		List<SFTPv3DirectoryEntry> DirList = sftp.ls(RemoteDir);
		if ( FileList == null ){
			FileList = new ArrayList<LogFile>();
		}
        for (SFTPv3DirectoryEntry Entry : DirList ){
        	//ディレクトリ以外
        	if (!Entry.longEntry.startsWith("d") ){
	        	LogFile file = new LogFile();
	        	file.setDirectory(RemoteDir);
	        	file.setFileName(Entry.filename);
	        	file.setHostName(conn.getHostname());
	        	file.setFileSize(Entry.attributes.size);
                //ファイル更新時間
	        	Date tm = new Date(Entry.attributes.mtime * 1000L);
	        	file.setUpDateTime(DateUtils.format(tm, DateUtils.FORMAT_YYYY_MM_DD_HH_MM_SS));
	        	FileList.add(file);
	    		
        	}
        }
        return;
	}

    /**
     * SFTPファイル受信
     * @param remoteFile　受信元ファイル
     * @param stream　出力ストリーム
     * 
     * */
    public void getFile( String remoteFile, OutputStream stream) throws IOException{
		if(conn == null){
			return;
		}
    	if(sftp == null){
            sftp = new SFTPv3Client(conn);
    	}
        long remoteFileSize = sftp.stat(remoteFile).size;
        // open remote file with read only
        SFTPv3FileHandle sftpFileHandle = sftp.openFileRO(remoteFile);
        
        BufferedOutputStream bos = new BufferedOutputStream(stream);
        		
        byte[] buffer = new byte[1024];
        long offset = 0;
        int readLength = 0;
        while( (readLength = sftp.read(sftpFileHandle, offset, buffer, 0, buffer.length)) != -1){
          bos.write(buffer, 0, readLength);
          offset += readLength;
        }
        // flush & Close
        bos.flush();
        bos.close();
        sftp.closeFile(sftpFileHandle);
        
        // compare
        if (offset == remoteFileSize) {
        } else {
        	System.out.println("failed: file size is different from remote. remote:" + 
              remoteFileSize+", local:"+offset);
        }
        return;
    }
}

画面処理
※HttpServletResponseのOutputStreamに直ファイルを突っ込むので、一時ファイルを置いたりしません。

/**
 * ログダウンロード画面
 * */
@ManagedBean(name="LogDownload")
@SessionScoped
public class LogDownload implements Serializable {
	private static final long serialVersionUID = 1L;

	protected static Logger logger = LogManager.getLogger();
	
    @EJB
    private SFTPFileAccess ftp;
    
    private String selectedServer;

    private List<LogFile> fileList;
    
	public LogDownload() {
		fileList = new ArrayList<LogFile>();
	}

	public List<LogFile> getFileList() {
		return fileList;
	}

	public void setFileList(List<LogFile> fileList) {
		this.fileList = fileList;
	}

	public String getSelectedServer() {
		return this.selectedServer;
	}

	public void setSelectedServer(String selectedServer) {
		this.selectedServer = selectedServer;
	}

	/**
	 * ディレクトリ選択時にファイル一覧を取得
	 * */
	public void getList(){
		try {
			Map<String,String> params = FacesContext.getCurrentInstance().getExternalContext().getRequestParameterMap();
			String fileDir = params.get("fileDir");

			ftp.loginHost(selectedServer, dao.getServerLoginUser(selectedServer), dao.getServerLoginPasswd(selectedServer));
			
			fileList.clear();
			ftp.getSFTPList(fileDir,fileList);
			
		} catch (IOException e) {
			e.printStackTrace();
		}
	}
	/**
	 * ファイルダウンロード
	 * */
	public void getFile(){
		Map<String,String> params = FacesContext.getCurrentInstance().getExternalContext().getRequestParameterMap();
		String fileName = params.get("fileName");
		String fileDir = params.get("fileDir");
	  
		try {
			HttpServletResponse response = (HttpServletResponse) FacesContext.getCurrentInstance() .getExternalContext().getResponse();
			response.setContentType("application/octet-stream");
			response.setHeader("Content-Disposition", "attachment;filename=" + fileName);

			OutputStream a = response.getOutputStream();
			ftp.getFile(fileDir +"/" + fileName , a);
			FacesContext.getCurrentInstance().responseComplete();
		} catch (IOException e) {
			e.printStackTrace();
		}
	}
}

xhtml
※ディレクトリリストの箇所は、上記ソース上割愛しています。
ディレクトリリストの左に置いたボタンクリックで、ファイル一覧を取得し、ファイル一覧のファイル名クリックでダウンロードします。

    <h:form id="listForm">
      <h:dataTable var="dirlist" value="#{LogDownload.directoryList}" rowIndexVar="rowIndex" class="table">
        <h:column>
          <f:facet name="header" >#{words.Label_LogList}</f:facet>
          <h:commandLink value="#{dirlist.INFO_VALUE}" actionListener="#{LogDownload.downLoad}">
            <f:attribute name="directory" value="#{dirlist.INFO_VALUE}"/>
          </h:commandLink>
        </h:column>
        <h:column>
          <h:commandButton id="listget" action="#{LogDownload.getList}" value="#{words.Label_FileListGet}">
            <f:param name="fileDir" value="#{dirlist.INFO_VALUE}" />
            <f:ajax render=":listForm:loglist"/>
          </h:commandButton>
        </h:column>
      </h:dataTable>
    
      <h:dataTable id="loglist" var="list" value="#{LogDownload.fileList}" styleClass="listTable">
        <h:column><f:facet name="header" >ファイル名</f:facet>
        <h:commandLink id="filelistName" value="#{list.fileName}" action="#{LogDownload.getFile}">
        <f:param name="fileName" value="#{list.fileName}" />
        <f:param name="fileDir" value="#{list.directory}" />
        </h:commandLink>
      </h:column>
      <h:column><f:facet name="header">ファイルサイズ</f:facet>
        <h:outputText value="#{list.fileSize}">
          <f:convertNumber groupingUsed="true" />
        </h:outputText>
      </h:column>
      <h:column><f:facet name="header" >ファイル更新日時</f:facet>
        <h:outputText value="#{list.upDateTime}"/>
      </h:column>
    </h:dataTable>    
  </h:form>

エラーハンドリングやサーバの切断、ファイルサイズの数値右寄せ等、細かい箇所がまだ出来ていませんが、とりあえず動きそうです。
最初、ログファイル情報のプロパティ名が先頭大文字とかだと、JSFでエラーになりちょっとハマりました。。

今、リクエストを受信した後に対外接続を行うシステムを作ってますが、がつがつと外部に繋ぐのも気が引けるという事で、、そのシミュレータとして簡単なWebAPも作りました。
APサーバは、WebLogic11G。作っているAPの仕様上、POSTをサーブレット処理してます。
で、結局Oracleのページに乗っていたグッドなサンプルをそのままパクってみました（汗）
Oracle Containers for J2EE サーブレット開発者ガイド
Request処理は解るのですが、Responseの方はFilter内でラップするというちょっと自分では考え付かない内容でした。。
上記に載っている、FilterServletOutputStreamとGenericResponseWrapperは、深く考えずに同一パッケージ内にそのままクラスとして作ります。
で、Filterクラスを作ってログを出力します。よく使っているlog4j2でやってます。

package jp.esoro.http;

import java.io.BufferedReader;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;

import javax.servlet.Filter;
import javax.servlet.FilterChain;
import javax.servlet.FilterConfig;
import javax.servlet.ServletException;
import javax.servlet.ServletRequest;
import javax.servlet.ServletResponse;
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
import javax.servlet.http.HttpServletResponse;

import org.apache.logging.log4j.LogManager;
import org.apache.logging.log4j.Logger;

public class PostFilter implements Filter {
	protected static Logger logger = LogManager.getLogger();
	
	@Override
	public void destroy() {
	}

	@Override
	public void doFilter(ServletRequest request, ServletResponse response,
			FilterChain chain) throws IOException, ServletException {
 		try {
 			//要求
			HttpServletRequest req = (HttpServletRequest) request;
			
			BufferedReader body = new BufferedReader(req.getReader());
			String ret = body.readLine();
			//要求ロギング
			logger.info(req.getRemoteAddr()+"->"+req.getLocalAddr()+":"+req.getLocalPort()+req.getContextPath() + ":" + req.getMethod() + " RCV:"+ret);

			OutputStream out = response.getOutputStream();
			
			GenericResponseWrapper wrapper = 
			         new GenericResponseWrapper((HttpServletResponse) response); 
			//この後、サーブレット側処理に移ります
			chain.doFilter(request, wrapper);	
			
			//ラップしたwrapperからサーブレットの処理結果を取得
			byte[] data = wrapper.getData();
 			//OutputStreamに書き込んで応答
			out.write(data);
			out.close();
			//Shift-JISでString変換
			String result = new String(data, "Shift-JIS");
			//応答ロギング
			logger.info(req.getRemoteAddr()+"<-"+req.getLocalAddr()+ ":"+req.getLocalPort()+ req.getContextPath() + ":" + req.getMethod() + " SND:"+result);

		} catch (IOException e) {
			logger.error(e.getMessage());
		}
	}
	@Override
	public void init(FilterConfig arg0) throws ServletException {
	}
}

で、web.xmlに上記Filterをセットします

 	<!-- Filter -->
	<filter>
		<filter-name>PostFilter</filter-name>
		<filter-class>jp.esoro.http.PostFilter</filter-class>
	</filter>
	<filter-mapping>
        <filter-name>PostFilter</filter-name>
        <url-pattern>/*</url-pattern>
    </filter-mapping>

最初サーブレットはアノテーション@WebServletで書きましたが、どうも11Gだとダメっぽいのでweb.xmlにservletをMappingする事にしました。シミュレータは本当に簡単なAPなので。。
開発環境は他のプロジェクトで使うWebLogic12cのままで11Gを別途用意しなかったんですが、実行環境が違うとデプロイに失敗して結構メンドクサイです。コンパイラーJavaのバージョンをちゃんと確認してなかったからなんですけど、、